Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLR2J2Q9GZM3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms