Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM6Q9C030 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms