Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDHR2Q9BYE9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDHR2Q9BYE9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms