Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms