Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms