Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CPPED1Q9BRF8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms