Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USB1Q9BQ65 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USB1Q9BQ65 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms