Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms