Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UHRF1Q96T88 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms