Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK5RAP2Q96SN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms