Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms