Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms