Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms