Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms