Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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