Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED3Q96IU2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED3Q96IU2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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