Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF496Q96IT1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF496Q96IT1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms