Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms