Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms