Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms