Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDAQ92838 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDAQ92838 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDAQ92838 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDAQ92838 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDAQ92838 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDAQ92838 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDAQ92838 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDAQ92838 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms