Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms