Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms