Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms