Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00518Q8N0U6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms