Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHSY1Q86X52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHSY1Q86X52 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1184.5 ms