Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRTM3Q86VH5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.2 ms