Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01551Q86U37 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms