Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms