Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ASCL4Q6XD76 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL4Q6XD76 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms