Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXD4L3Q6VB84 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms