Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms