Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LETMD1Q6P1Q0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms