Protein–RNA interactions for Protein: Q68D51

DENND2C, DENN domain-containing protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2CQ68D51 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2CQ68D51 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms