Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WSCD1Q658N2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WSCD1Q658N2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms