Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms