Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL1Q5VZK9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms