Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND4CQ5VZ89 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms