Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GKAP1Q5VSY0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms