Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PXDC1Q5TGL8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms