Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SOGA3Q5TF21 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOGA3Q5TF21 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms