Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.63■■■■□ 3.14
ERCC6L2Q5T890 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
ERCC6L2Q5T890 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6L2Q5T890 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms