Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PERM1Q5SV97 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms