Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP55Q53EZ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms