Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD55Q3KP44 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms