Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
QSER1Q2KHR3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms