Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
FOXD1Q16676 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms