Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NREPQ16612 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NREPQ16612 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NREPQ16612 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NREPQ16612 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NREPQ16612 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NREPQ16612 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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