Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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