Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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RPE65Q16518 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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RPE65Q16518 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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RPE65Q16518 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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RPE65Q16518 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RPE65Q16518 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RPE65Q16518 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RPE65Q16518 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPE65Q16518 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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